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Modèle de portail

Thursday February 14 th 2019

La précision du modèle dépend de façon critique de l`accessibilité des structures de gabarit appropriées. Les bases de données contenant des modèles précompilés sont basées sur les meilleures structures de gabarit disponibles au moment où le modèle a été calculé et concentrent généralement leurs efforts sur un nombre limité de protéines cibles pour des raisons d`efficacité. Par conséquent, les dates de vérification du modèle et du modèle sont clairement affichées sur les pages de détails du modèle dans PMP. Bien qu`un modèle précalculé dans PMP représente une base d`informations de structure minimale pour une séquence de protéines donnée, des modèles améliorés peuvent être accessibles en utilisant des structures plus récemment libérées dans l`APB. Par conséquent, PMP fournit une interface à plusieurs serveurs de modélisation établis pour initier de manière interactive un nouveau processus de sélection et de modélisation de modèle pour une protéine cible. Jusqu`à présent, nous avons mentionné quelques conseils différents. Le tableau suivant décrit les indicateurs de modèle de portlet disponibles pour l`utilisation. L`étape suivante consiste à permettre aux utilisateurs de personnaliser leur interface et leur expérience via des portails personnalisés. Ceux-ci améliorent les informations génériques offertes dans les portails généralisés. Avec la personnalisation, vous pouvez désormais prendre en charge un modèle spécialisé. Ceux-ci reposent sur une base d`utilisateurs bien définie plutôt que sur un volume utilisateur élevé. Un site ciblé attire un groupe spécifique d`annonceurs désireux de payer une prime plus élevée pour atteindre un certain public. Vous pouvez utiliser l`élément d`indicateurs par défaut pour définir une liste d`indicateurs à appliquer à chaque champ d`un modèle.

Par exemple, l`ajout de l`élément suivant à l`intérieur d`un élément de modèle applique une largeur d`affichage de 300 à chaque champ: le PMP a été développé pour favoriser l`utilisation efficace des modèles moléculaires dans la recherche biomédicale en fournissant un accès pratique et complet aux des informations structurelles pour une protéine spécifique. Pour la première fois, les structures expérimentales et les modèles théoriques pour une protéine donnée peuvent être recherchés simultanément et analysés pour la variabilité structurelle. La qualité de chaque modèle est indiquée, et les modèles obsolètes sont marqués pour être directement soumis à nouveau via l`interface du portail propre aux serveurs de modélisation enregistrés. Le PMP peut être interrogé à l`aide de séquences d`acides aminés, de texte libre ou de divers codes d`accession à la base de données, et les résultats sont présentés de manière intuitive et graphique. Les informations structurelles disponibles (expérimentales ou théoriques) sont visualisées et complétées par des annotations fonctionnelles et de domaine pour une protéine d`intérêt. Pour chaque modèle précalculé, PMP affiche des informations techniques telles que la date de création et la date de vérification, l`identité de la séquence du modèle et la précision du modèle attendue en fonction de la distance évolutive entre la cible et le modèle. Cependant, avec le nombre toujours croissant de nouvelles séquences protéiques, il n`est plus possible de maintenir des modèles précalculés pour toutes les protéines, et par conséquent, la plupart des fournisseurs de ressources modèles ont décidé de se concentrer sur les sous-ensembles des données, par exemple les organismes modèles sélectionnés ou familles de protéines spécifiques. Les interfaces de soumission PMP aux moteurs de modélisation interactifs devraient donc devenir plus pertinentes à l`avenir. Eh bien, vous avez appris l`art de la persuasion à travers les indices du modèle de Liferay. Maintenant, vous pouvez non seulement influencer la façon dont les champs de saisie de votre modèle sont affichés, mais vous pouvez également définir ses tailles de colonne de table de base de données. Vous pouvez organiser des conseils, insérer des conseils individuels directement dans vos champs, appliquer un ensemble d`indicateurs par défaut à tous les champs d`un modèle ou définir des collections d`indicateurs à appliquer à l`une de ces étendues.

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